禹汇川(副研究员 硕士生导师)

      主要从事表观遗传学、基因组学、核酸修饰组学、临床组学和转化医学研究。以中山大学作为通讯作者第一单位,作为第一或通讯作者发表高水平文章20多篇,影响因子10分以上8篇,包括JAMA Oncol、J Natl Cancer Inst、J Natl Compr Canc Netw、Nat Commun、iScience、J Immunother Cancer、Clin Chem 等国际权威杂志,多篇论文被选为封面论文。主持国家自然科学基金2项、广东省自然科学基金3项等多个国家级和省级科研项目。拥有多项落地成果,第一发明人获得国家发明专利授权2项,申请PCT国际专利2项、软件著作权2项,是入选2021年全国高价值专利项目的15项成果之一。目前为美国癌症研究协会(AACR)会员(Active Member)、Journal of Gene Medicine 编委。代表性成果包括:研发了第三代甲基化特异性PCR技术QASM,实现在单碱基分辨率下检测基因组甲基化水平 (Clin Chem 2019),解决了基因组CpG匮乏区甲基化PCR定量的难题,入选美国临床化学学会年度论文,并在国际上十个著名医疗中心进行了应用,揭示了表观基因组“暗物质”——CpG匮乏区甲基化的肿瘤标志物价值(JNCI 2022;同期社评);在表观遗传水平,开发了可以定量评估肿瘤微环境免疫细胞浸润的技术体系CD8+ MeTIL (J Immunother Cancer 2021),评估疾病状态下的生物学衰老进程(Nat Commun 2022;F1000论文),揭示了基于非经典核酸构象转换的炎症因子调控机制 (iScience 2022);系统揭示了非转移性肿瘤免疫治疗中普遍存在的“假残留”影像-病理分离特征(JNCCN 2022a),为环境暴露组和传感器组等组学领域设计了“去中心化”研究范式 (JAMA Oncol 2019),构建了肿瘤生物标志物的时间异质性研究和应用范式(JNCCN 2022b)。


研究方向:
1.研发新型化学生物学检测技术和算法工具,绘制不同生理和病理状态下人体组织和细胞的遗传学和表观遗传学特征
2.疾病中的表观遗传学机制和免疫遗传学改变
3.疾病生物标志物


教育工作背景:
2021-12~至今,中山大学附属第六医院,胃肠病学研究所,副研究员
2019-12~2020-07,美国Fred Hutchinson肿瘤研究中心,访问学者
2016-12~2021-12,中山大学附属第六医院,胃肠病学研究所,助理研究员
2014-07~2016-12,中山大学附属第六医院,结直肠外科,医师
2006-09~2014-06,中山大学中山医学院、中山大学附属第六医院,临床医学八年制,博士

代表性论文代表性项目荣誉
1.Shen D#, Wang X, Wang H, Xu G, Xie Y, Zhuang Z, Huang Z, Li J, Lin J, Wang P, Huang M, Luo Y, Yu H*. Current Surveillance After Treatment is Not Sufficient for Patients With Rectal Cancer With Negative Baseline CEA. Journal of the National Comprehensive Cancer Network. 2022 Mar 1:1-10.
2.Cao X#, Li W, Wang T, Ran D, Davalos V, Planas-Serra L, Pujol A, Esteller M, Wang X, Yu H*. Accelerated biological aging in COVID-19 patients. Nat Commun. 2022 Apr 19;13(1):2135.
3.Zou Q#, Wang X#, Ren D#, Hu B, Tang G, Zhang Y, Huang M, Pai RK, Buchanan DD, Win AK, Newcomb PA, Grady WM, Yu H*, Luo Y*. DNA methylation-based signature of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes enables evaluation of immune response and prognosis in colorectal cancer. J Immunother Cancer. 2021;9.
4.Wang X#, Chen S#, Zhao Z, Chen F, Huang Y, Guo X, Lei L, Wang W, Luo Y, Yu H*, Wang J*. Genomic G-quadruplex Folding Triggers a Cytokine-mediated Inflammatory Feedback Loop to Aggravate Inflammatory Diseases. iScience. 2022.
5.Xie Y#, Lin J#, Zhang N#, Wang X, Wang P, Peng S, Li J, Wu Y, Huang Y, Zhuang Z, Shen D, Zhu M, Liu X, Liu G, Meng X, Huang M, Yu H*, Luo Y*. Prevalent Pseudoprogression and Pseudoresidue in Rectal Cancer Patients Treated with Neoadjuvant Immune Checkpoint Inhibitors. Journal of the National Comprehensive Cancer Network. 2022.
6.Yu H#, Wang X, Bai L, Tang G, Carter KT, Cui J, Huang P, Liang L, Ding Y, Cai M, Huang M, Liu H, Cao G, Gallinger S, Pai RK, Buchanan DD, Win AK, Newcomb PA, Wang JP*, Grady WM*, Luo Y*. DNA Methylation Profile in CpG-depleted Genomic Region Uncovers an Epigenetic Subtype with High Risk of Recurrence in Early-stage Colorectal Cancer. J Natl Cancer Inst. 2022.
7.Yu H#, Luo Y*. Decentered Crowdfunded Clinical Studies-Open a New Era of Medical Research. JAMA Oncol. 2019;5:9-10.
8.Yu H#, Bai L, Tang G, Wang X, Huang M, Cao G, Wang J, Luo Y*. Novel Assay for Quantitative Analysis of DNA Methylation at Single-Base Resolution. Clin Chem. 2019;65:664-673.